Forskere ved Institutt for bioteknologi ved Universitetet i Innlandet har lenge jobbet med å utvikle raskere tester for infeksjoner. I dag må sykehus dyrke bakterier for å finne hva som feiler pasienten og det tar to til fire dager – og ofte lenger – før man får svar.
De har utviklet en metode med bruk av direkte nanopore-sekvensering uten dyrking og med sanntids dataanalyse som er både kostnadseffektiv og treffsikker. Med denne metoden kan man få svar på prøvene på sekunder.
Nå presenterer forskerne sine funn i en artikkel i det internasjonale topptidsskriftet Nature Communications, i samarbeid med forskere i Tyskland.
Stipendiatene Sverre Branders og Anurag Bellankimath er førsteforfattere av artikkelen Metagenomic sequencing enables accurate pathogen and antimicrobial susceptibility profiling in complicated UTIs in approximately four hours. Professor Rafi Ahmad er leder av forskergruppen og sisteforfatter.
Veldig lovende resultater
I studien tester forskerne diagnostikk av urinveisinfeksjoner. 405 millioner mennesker får urinveisinfeksjon hvert år, og det å få en rask diagnose er avgjørende for riktig medisinering.
Studien sammenligner elleve måter å forberede prøver på uten å dyrke bakteriene. Den forbedrede DNA‑metoden fant riktig sykdomsframkallende bakterie i 99 prosent av tilfellene. Med andre ord: metoden identifiserer nesten alltid hvilken bakterie som gir infeksjonen.
– Vi kan nå dokumentere at metoden vår kan erstatte dagens praksis, hvor det brukes store mengder bredt virkende antibiotika mens legene venter på svar. Det betyr bedre behandling av pasienter og mindre risiko for at bakteriene utvikler resistens, sier professor Rafi Ahmad.
Hurtigdiagnostikk er et felt i sterk utvikling. Forskerne ved INN hevder deres metode er opptil 30 prosent mer økonomisk enn andre metoder.
– Kostnadseffektivitet er veldig viktig når man innfører ny teknologi. Dette er en rimelig løsning for sykehus og klinikker. I tillegg kan de spare penger på kortere sykehusopphold, sier Rafi Ahmad.
Raskere tester, smartere antibiotikabruk
Metoden klarer også å predikere antibiotikafølsomhet, altså forutsi hvilken antibiotika som virker, med en nøyaktighet på 90 prosent, skriver forskerne i artikkelen.
Antibiotikaresistensen i verden øker dag for dag og vi er sakte men sikkert i ferd med å miste et viktig våpen i moderne medisinsk behandling. Redusert og mer treffsikker bruk av antibiotika er avgjørende i kampen for å motvirke dette.
Raskere diagnostisering vil kunne være et viktig tiltak. I dag gis ofte de som blir syke et bredt spekter av antibiotikum, basert på klinisk mistanke om en infeksjon. Det fordi legene ennå ikke har sikker laboratoriebekreftelse på hvilken mikroorganisme som forårsaker sykdommen og hvilken behandling den er følsom for.
– Hvis hurtigdiagnostikken blir tilgjengelig på sykehus og klinikker rundt i verden, vil det sørge for at pasientene får riktig type antibiotika raskere og bruken av antibiotika globalt vil reduseres, sier Ahmad.
I tillegg til Branders, Bellankimath og Ahmad, er medforfattere Isabell Kegel, Torsten Hain, Florian Wagenlehner og Can Imirzalioglu fra Justus-Liebig-Universität Gießen, Truls E. Bjerklund Johansen fra Universitetet i Oslo og Jawad Ali og Fatemeh Asadi fra INN.
Kontaktperson:
- E-post
- rafi.ahmad@inn.no
- Telefon
- +47 62 51 78 45