English version of this page

Funksjonell & diagnostisk genomikk

Tilhørighet:
Fakultet for anvendt økologi, landbruksfag og bioteknologi
Fagområde:
Natur, biologi og miljø
Kvinne med reagensrør i laboratorium
Foto: Lars Martin Bøe/HINN

Hva forsker vi på?

Molekylærgenetikk er et vidt felt som spenner fra funksjonell genomikk/epigenomikk, som omhandler analyser av genfunksjon/funksjonelle konsekvenser av kromatin modifiseringsstatus, til utvikling og utnyttelse av nye DNA teknologier til karakterisering av mikroorganismer, planter, og dyr, inklusiv mennesker. 

Mer om forskergruppen

Funksjonell genomforskning inkluderer genetikk, proteinbiokjemi og celle- og molekylærbiologi i både ville og CRISPR/Cas-genomredigerte organismer for å forstå grunnleggende biologiske fenomener der målet er å utvikle plantesorter eller husdyrraser med ønskede avlstrekk.

Funksjonell metagenomikk innebærer oppdagelse og karakterisering av nye metabolske veier i mikrobielle samfunn viktig i landbruket, industrien, miljøet, samt humanhelse.

Genetiske og epigenetiske markører identifisert fra funksjonelle studier kan utvikles som diagnostiske verktøy som kan hjelpe å sikre effektiv bioremediering av vann, jord og sedimenter, og sikker produksjon og prosessering av matplanter, husdyr, fisk og mat. Humane og mikrobielle markører er anvendelig i medisinsk diagnostikk.   

Prosjekter fra 2016; som prosjektledere eller partnere:

  • 2024 - 2027. GE-Sustain: Sustainable potato production in Norway by precision breeding; Project partner (Castillo Avila, Johansen & Wilson); Norwegian Research Council (NRC; program IPN, FFL/JA); Project number 346664; Project owner: Graminor AS.
  • 2024 - 2026. Liquid Array Diagnostics for rapid diagnostics in acute myeloid leukemia; Project partner (Wilson); Helse Sør-Øst (PhD-stipend-prosjekt); SøknadsID: 37481; Project owner: Oslo universitetssykehus.
  • 2023 - 2026. Impact of influent carbon load on phosphorus-removal performance and the associated ecophysiology of the Hias Process; Project leader (Johansen); Regional Research Fund Region Innlandet (RFFINNL program: KSP); Project number: 341327. Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.
  • 2020 - 2022 Kartlegging av de biologiske prosessene som styrer fosfor og nitrogen rensing i Hias biofilmen; Project leader; Regional Research Fund Region Innlandet (RFFINNL); Project number: 313463. Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.
  • 2019 - 2020. Metodikk for karakterisering av biofilm i Hias-prosessen. Project leader; Innovation FORREGION; Project number: 304496. Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.
  • 2015 - 2018. From the Laboratory to the Field: Biomarkers for Low Temperature Tolerance in Strawberries; Project partner (Ghai Njah, Johansen &Wilson); Norwegian Research Council (NRC; program BIONÆR) project number 244658/E50. Project owner: Graminor AS.
  • 2015 - 2017. Using the moss Physcomitrella patens as a tool to understand the role of DEK1 in plant body patterning and evolution. Project partner (Johansen & Wilson); NRC (program FRIMEDBIO); Project number 240343. Project owner: Norwegian University of Life Sciences.
  • 2015 - 2017. Liquid Array Diagnostics. Project partner (Wilson & Rudi - via NMBU); Norwegian Research Council (NRC; program FORNY): project number 243870; Project owner: Kjeller Innovasjon.

Prosjekter siden 2016; som samarbeidspartnere med andre forskergrupper ved HINN:

Samarbeid med B3 - Bioinformatics, Biodiscovery & Biorefinery

  • 2024. WatRes: antibiotic resistance Status at HiAS inlet and effluent water; Collaborator (Johansen); Regional Research Fund Region Innlandet; Project number: 350084. Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.

Samarbeid med Reproduction biotechnology

  • 2023 - 2033. Centre for Embryology and Healthy Development (CRESCO); Collaborator (Wilson); Norwegian Research Council (NRC, program SFF); project number: 332713; Project owner: University of Oslo.
  • 2022 - 2028. Zygote – Kapasitetsløft innen bærekraftig avl og anvendt bioteknologi for Innlandet; Collaborator (Wilson); Norwegian Research Council (NRC, program KSP) project number: 331878; CRIStin-ID: 2602847; Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.
  • 2017 - 2020. Elucidation of underlying factors influencing fertility in modern, efficient livestock production through novel epigenomics and metabolomics; Collaborator (Wilson);   Norwegian Research Council (NRC, program MAT-SLF) project number: 268048; CRIStin-ID: 558757; Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.
  • 2016 - 2019. Nye verktøy for bærekraftig avl og høy fruktbarhet i effektiv husdyrproduksjon; Collaborator (Wilson); Norwegian Research Council (NRC, program MAT); CRIStin-ID: 532169; Project owner: Inland Norway University of Applied Sciences.

Nettverk

Nasjonale samarbeidspartnere

  • Professor Paul Grini (Norway, UiO)
  • Professor Lars Gustav Snipen (Norway, NMBU)
  • R&D Director / Associate Professor Muath K Alsheikh (Norway, Graminor Breeding Ltd / NMBU)
  • Researcher Tage Thorstensen (Norway, NIBIO)
  • Head of Dept. & Research Carl Gunnar Fossdal (Norway, NIBIO)
  • Senior Physician Tor Henrik Anderson Tvedt, Ph.D. (Norway, OUS)
  • Researcher Carl Jonas Spetz (Norway, NIBIO)
  • Researcher Jahn Davik (Norway, NIBIO)
  • Professor Odd Arne Rognli (Norway, NMBU)
  • Researcher Mallikarjuna Rao Kovi (Norway, NMBU)
  • Professor Achim Kohler (Norway, NMBU)
  • Senior Process Engineer Torgeir Saltnes (Norway, HIAS H2O)
  • Operations Engineer Gjermund Sørensen (Norway, HIAS IKS)
  • Consultant Sondre Eikås (Norway, HIAS IKS)

Internasjonale samarbeidspartnere 

  • Researcher Pierre Francois Perroud (France, INRA)
  • Associate Professor Dennis Eriksson (Sweden, SLU)
  • Researcher Viktor Demko (Slovakia, UNIBR)
  • Professor Stephen K. Randall (USA, IUPUI)
  • Professor Dan Sargent (UK, NIAB)
  • Professor Francesco Nonnis Marzano (Italy, UNIPR)